办理厂房房产证的费用通常包括以下几个方面：
工本费
居民住宅每套80元，如有共有权证增收工本费10元/本。
其它房产建筑面积500（含500）㎡以下的每宗200元，500~1000㎡的为300元，1000~2000㎡的为500元，2000~5000㎡的为800元，5000㎡以上的为1000元。如共有权证增收工本费10元/本。
税费
商品房契税 ——1.5%（非普通住宅3%）
印花税 ——0.1%
土地使用税、增值税等其他税费根据当地政策及厂房具体情况缴纳
其他费用
测绘费、登记费、劳务费等其他可能的行政费用。
请注意，上述费用可能因地区、政策变化及具体情况而有所不同。建议在办理前咨询当地房产局或专业律师获取最准确的信息