水稻苗发黄的原因有多种，主要包括以下几个方面：
缺肥
缺氮：植株生长缓慢、矮小，叶色变淡，从老叶开始叶尖发黄，逐渐扩展至整个叶片，严重时整株水稻叶片发黄。
缺钾：老叶尖端及边缘先发黄，随后逐渐向叶片中部扩展，形成黄褐色斑点或斑块，严重时叶尖干枯、卷曲。
缺锌：土壤中锌元素含量不足，或者长期淹水导致土壤还原性增强，降低锌的有效性。表现为叶片中下部出现棕色锈斑，逐渐扩大并连成条状，新叶基部失绿发白，老叶沿叶脉两侧出现褐色小斑。
缺磷：磷是水稻生长的重要营养元素，缺乏磷会导致水稻生长受阻，叶片发黄。
水分失调
干旱：长期缺水会使水稻生长受到抑制，叶片为减少水分蒸发会关闭部分气孔，导致光合作用减弱，叶片因营养供应不足而发黄。
淹水过深：长时间淹水或田间积水，会使土壤透气性变差，土壤缺氧，根系呼吸受阻，影响根系对养分和水分的吸收，进而导致叶片发黄，生长缓慢，严重时植株枯萎。
病虫害
病害：如白叶枯病、黄矮病等病害会使水稻叶片出现不同程度的黄斑、褐斑。
虫害：如稻飞虱、螟虫等，它们吸食水稻汁液，破坏叶片组织，导致叶片发黄干枯。
土壤问题
土壤质地：土质过黏或过沙都会影响水稻根系的生长和发育，导致叶片发黄。
土壤酸碱度：土壤酸碱度不适宜也会影响根系生长，当土壤 pH 值低于 5.5 或高于 7.5 时，可能导致水稻根系生长受抑制。
土壤养分失衡：缺乏氮、磷、钾等大量元素或锌、硼、钼等微量元素，都会影响根系的正常生长和发育。
管理不当
秧田整地质量差：如卧垡多、块大而硬，畦面无法整平、整细，山淤土区域更明显，导致根系生长受阻，影响养分吸收。
脱肥：苗床没有进行培土或用营养土配制，导致秧苗在2.5~3叶期后出现黄化、叶尖干枯等症状。
施肥施药不当：如叶面补充肥料浓度偏大，或喷施不均匀，或喷肥后没有及时洗苗，容易引起叶片灼伤，出现褪绿黄化或叶尖干枯等现象。
中毒
有机酸过多：造成田间中毒现象，主要症状不发新根，表皮脱落，叶色发黄，严重的直接枯死。
综合以上原因，要解决水稻苗发黄的问题，需要从施肥、水分管理、病虫害防治、土壤改良等多方面入手，确保水稻生长所需的养分和水分供应充足，并及时采取相应的管理措施。