农村违建的管理主要由以下部门负责：
自然资源部门：
负责查处违法占用农用地进行建设的行为。
农业农村部门：
负责查处农村村民违法占用农村宅基地建住宅的行为。
乡（镇）人民政府：
对于拥有合法宅基地但未取得建设规划许可证的违法建筑，由乡镇人民政府负责查处。
住房城乡建设主管部门：
根据乡村建设工程具体类别不同，分别进行质量安全管理。
其他监管部门：
对于违反法律、法规及其他规定的行为，由其他监管部门依法查处。
当发现农村存在违建情况时，村民或相关部门可以及时向上述机构反映，以便及时采取措施予以纠正