当破产清算申请被驳回时，可以采取以下措施进行处理：
仔细研究驳回理由
认真学习并理解驳回申请的具体原因，这通常会在驳回通知中明确说明。
可能的原因包括提交的材料不齐全、程序不符合规定或其他影响清算的问题。
补充完善相关材料
根据驳回理由，及时补充缺失的材料或修正不符合规定的材料。
确保所有提交的材料真实、准确、完整且符合法律要求。
与审查机关沟通
与负责破产清算审查的机关进行沟通，了解他们的具体意见和要求。
诚恳地表达解决问题的意愿，寻求他们的指导和帮助，以更好地完善申请。
寻求专业法律意见
如果对驳回决定及后续处理存在疑问或困惑，可以咨询专业的律师。
律师能够根据具体情况提供更详细、准确的法律建议，帮助制定合理的应对策略。
重新提交申请
在完成材料补充和沟通后，按照审查机关的要求重新提交破产清算申请。
在提交时，要格外注意避免再次出现之前被驳回的问题，以提高申请通过的几率。
总之，面对破产清算审查驳回，要积极采取措施，认真对待并妥善处理，以推动破产清算程序的顺利进行。